科学使用农药在花木的病虫害防治、除草等灾害方面的作用是积极的，但是，由于过去人们对自然界之间相互依存、相互制约的规律认识不够，过分的依赖化学农药的杀伤作用而滥用农药，缺乏生态的整体观念，从而导致了一系列令人担忧的生态问题，这些问题我们总结如下：
    一、引起抗药性
    长期使用同种农药，导致了病虫害抗药性的产生，使化学农药效力大大下降，从而不得不提高单位面积的施药次数，也相应的提高了防治费用。
    二、引起灾害再猖獗和次要灾害的大发生
    如果经常大面积施药防治国槐尺蠖的地区，除了增强国槐尺蠖的生活力和抗药性外，由于杀伤了大量天敌，反而引起了国槐尺蠖的猖獗，同时又可以引起其它次要虫害的猖獗。
    三、污染环境，产生残害问题。
    农药不仅可以直接污染环境，或通过沟渠、河流、湖海而散播，或经生物界的食物链关系，逐步浓缩成对生态系统的影响，而且农产品中的残害也是值得注意的。
    四、杀伤天敌，破坏生态平衡。
    天敌是生态系统的重要成员，往往一种天敌能食多种害虫，因此抑制着许多次要害虫使之不易造成经济损失。而不合理的化学防治，特别是全部施药防治，必然导致天敌大量死亡，破坏生态平衡。
    合理使用农药的基本原则和方法：
    1、对症下药。在防治病虫害选用的农药种类和剂型时，应选用既能取得防治效果，又没有副作用的农药。用药前，必须了解解药剂的性能和防治对象，做到对症下药。
    2、适时施药。要掌握防治病虫害发生发展的动态，做到治早治小。一般害虫在幼虫时抗药性弱，而且刚从卵里孵化出来，往往又群集性，抓住这个有利时机，及时用药防治。
    3、合理的用药量和施药次数。无论哪一种农药，施药浓度和用药量都要适当。用药量过大不但污染环境，而且植物易产生药害，药量太小无效果，造成人力物力上的浪费。我们在调查和测报环境的基础上，根据病虫害的发生发展情况，决定施药次数，绝不能不了解情况，随意施药。
    4、交互用药。长期使用一种农药防治一种病害或者是虫害，易是病害或虫害产生抗药性，降低防治效果。经常轮换使用几种不同的农药，是防治病菌或害虫产生抗药性的有效措施。
    5、合理混用农药。各种农药各有其优缺点，混合使用可以互补缺点，发挥所长，起到增效或兼治两种以上病虫害。但是，混用并不是所有的农药都适宜，更不是种类越多越好，混用不当的话，会是药物没有药用。一般的混用的原则：同类农药可以混用，植物性农药、微生物农药可与有机农药混用。但是酸性农药与碱性农药是不能混合使用的。